2006年北京医药工业销售利润率为9.9％，遥遥领先国内其它地区。但北京医药工业企业的规模普遍偏小，北京医药工业销售收入和利润总额的29.5％和27.5％分别由亿元以下中小企业来支撑，这一比例要高于全国平均水平。

　　北京新药产出数量位居全国领先地位。在新兴的生物制品领域，北京地区新药获得批准的数量远远超过其它省市。

　　此外，北京药品消费也依旧排名全国首位。特别是在医院用药方面，北京居全国第一。2006年，北京地区医院用药金额约为124.5亿元，比上年增长14％。其中，抗肿瘤和免疫调节剂类药物增长最快，由2005年的第五位上升至去年的第三位。主要原因是北京的老龄化人口比例高于全国平均水平。研究表明，平均每增加一岁，恶性肿瘤的发病率每10万人约上升11.44例。而且在大城市，空气、噪声、辐射等污染也使肿瘤发病率高于农村。