酮苷的提取工艺，同样得到较理想的结果。此外，阎欲晓等从生姜中提取抗氧化物质，结果发现先用微波处理5分钟，黄酮的提取率明显提高。
郭振库等对黄芩中黄芩苷微波提取作了研究，用正交设计优选了最佳工艺为70%微波功率(最大功率850瓦)下，以35%乙醇作溶剂，溶剂30倍量，压力0.15Mpa，恒压时间30秒即可获得较好的得率，比超声法高出近10%。张梦军等用均匀设计法考察了微波提取甘草黄酮的最佳条件为：固液比1/8，乙醇浓度78%，微波功率388瓦，提取时间1分钟。微波法提取率(24.6mg/ml)明显优于水提法(11.4mg/ml)。
陈斌等研究微波萃取葛根异总黄酮的工艺，用77%乙醇，固液比1/14，在低于60℃条件下，微波间歇处理3次，总黄酮浸出率达95%以上，与传统的热浸提相比，不仅产率高，而且速度快，节能。
王绢等应用微波萃取葛根中的总黄酮、葛根素，结果表明提取效率明显提高，提取时间明显缩短，有效成分的得率显著提高。
④皂苷类
有研究发现，用微波法提取重楼皂苷，结果微波处理5分钟的效果即基本达到2小时常规加热的效果，而且杂质少，微波提取10分钟即可认为皂苷已提取完毕。
⑤有机酸
郭振库等应用自行设计的具较高压力控制精度的专用微波制样系统，对金银花中有效成分绿原酸和异绿原酸类化合物的提取条件进行了考察，并与超声波提取比较，提取率比超声波高近2成。
郭锦堂等应用微波提取甘草酸，8分钟可得到与连续回流提取3小时相当的结果。
⑥多糖类
新疆石河子大学药学院的工作者在用微波萃取多糖的研究上作了大量工作，提取的植物包括甘草、商陆、肉苁蓉、红景天根、红景天叶、黄芪、党参等。他们在MCL-3微波反应器中，用一定量石油醚、乙醚和80%乙醇回流提取20分钟，残渣再放入微波炉中，用水提取20分钟后测定多糖含量，结果提取率均高于传统方法，提取时间缩短了约12倍。
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