ers。1.0 units of Taq DNA Polymerase(MBI),模板DNA1O0~200ng,总反应体积25μ1。PCR循环参数为:95℃预变性3min;95℃ 45s,58℃ 60s,72℃ 45s,共35个循环;72℃延伸5min。 1.3.3 PCR产物的高效毛细管电泳 在电泳分析前,先将毛细管柱填充1g/L HPMC,再充以含有3.75μmol/L溴乙锭的8g/L HPMC,电泳分离的缓冲溶液为TBE溶液(45mmol/L Tris,45mmol/L boric acid,1 mmol/L EDTA,pH 8.5)。取PCR扩增产物1Oμl加入内标2×0.0001mol/L Sulforhdamine B溶液0.5μl,在-1OkV下电动进样20 s,并在-1OkV下恒压电泳,用543.5nm 波长的激光激发DNA片段与溴乙锭的结合物产生荧光,在590nm波长下检测。电泳温度为20℃。每次电泳后用0.01 mol/L H3PO4溶液冲洗毛细管5min,再进行下一次检测。pUC19DNA/Msp I(HpaⅡ)Marker用作DNA marker,使用时Maker用适量无菌水稀释。电泳图谱和实验数据用C++语言编制的windows软件进行采集和分析处理。 1.3.4 PCR产物的琼脂糖凝胶电泳 将5μl PCR产物与1μl上样buffer混合后上样于30g/L琼脂糖凝胶中(含0.1μg/ml溴化乙锭)。在0.5×TBE电泳缓冲液中,于100V电压下,电泳50min,采用pUC19DNA/Msp I(HpaⅡ)DNA Marker同时电泳,然后用UVI紫外成像分析仪观察结果。 2 结果与讨论 2.1 毛细管电泳条件的优化 2.1.1 毛细管柱长和内径的选择 分别采用不同内径和长度的涂层石英毛细管柱:50cm×50μmi.d.;50 cm × 75μmi.d.;50cm×100μm1.d.;40cmx 100μm i.d.进行试验。实验结果表明,内径为100μm的毛细管对DNA 片段标准物质pUC19DNA/Msp I(Hpa Ⅱ)Marker 中的110(111)/147 bp DNA 片段的分离度可达2.91,而且内径为100μm的毛细管柱检测光程较大,因而较内径为50μm和75μm的毛细管柱的检测灵敏度高。采用上一页 [1] [2] [3] [4] [5] [6] 下一页 |
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