中药和生药归属于两个不同的学科体系。从研究的路线来看：中药的研究是从临床开始的，疗效是确定的，起点就是药物，所含的组分是药效组分，研究出来的新药是升级产品，要从二期临床开始；生药的研究是从生物开始的，疗效不确定，起点是动、植物，所含的成分是有效成分或活性成分，研究出来的新药是从实验药理学开始的。
从学科的内涵来看，中药学的二级学科是中药鉴定学、中药炮制学、中药药理学和中药制剂学，主要研究中药的质量标准和鉴定方法，饮片的炮制加工技术、中药的生物效应和作用机理，制剂工艺技术等问题；生药学的二级学科则是天然药物化学、实验药理学和制剂学，主要研究生药化学成分及其生物活性、实验药理学方法和制剂工艺技术等问题。
从本质上讲，中药具有独特的理论体系和悠久的临床应用历史，是中国药典规定的药物；而生药不是药典规定使用的药物。不难看出，如果我们用研究生药的方法研究中药，研究出来的产品既不是中药也不是生药或化学药物。如果我们用生药的学科去套用中药的学科，会造成学科体系的混乱，出现了培养目标的偏移，不管我们如何强调中药人才培养的重要，实际的培养模式已经导致了中药人才培养畸形状态的现实。人是第一生产力，如果中药的人才培养出了问题，中医药的发展该向何处去？
2、在生药定位的基准上建立中药的化学成分的质量标准，是造成了现行中药质量标准脱离临床的关键
中药的质量标准必须能够科学地表述中药的疗效特征；而生药的标准是以活性成分为指标的，二者具有本质的区别。由于对中药的定位错误，中药的现行标准实际上是不规范的生药标准，中药标准在执行过程中出现了导向性错误，导致中药疗效的不确定性，造成了患者对中药疗效和安全性的信任危机，直接危及了中医药的存亡。中药的现行标准脱离临床主要表现如下：
2.1 用药材（生药）的化学成分作为指标建立中药的质量标准，造成了真正的中药没有标准
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